一、 母丸：母丸为泛丸的基础颗粒，是制作水丸的关键。先将少许冷开水或喷或抹于药匾（水丸筛）内，随即撒入少量药粉，使药粉全部湿润并均匀粘附后，用干燥刷子将药粉缓缓刷下，形成细小潮湿颗粒，再加入少量药粉，使颗粒随着药匾的摆动，逐渐加大滚圆。如此喷水加粉反覆操作约二十次，即有细丸出现。 

二、 泛丸：取母丸按上述方法在药匾中反覆操作，加入药粉及粘合剂，约二十次可成紫苏子大小之中丸，再泛一百次可成标准大小之水丸。注意药匾之摆动，务使水丸之表面光滑，大小均匀。 
三、 干燥：制成的水丸，应及时于低温下烘干，含有芳香性药物者只宜置通风处阴干。 
四、 包衣打光：须包衣者，将干燥之水丸，用适当的液体湿润，加入包衣材料旋转包衣，再以低温干燥。须打光者，用旋转打光，使丸剂表面湿润带光泽。 
五、 包装：水丸置于密闭之容器或塑胶袋中，严防受潮，高温及虫害。